(一)國家科學及技術委員會計畫(一般型)

1. 國家科學及技術委員會，環境友善型生物質衍生加值碳材應用於光熱轉換活化過硫酸鹽整治1,2-二氯乙烷污染地下水之機制與成效研究，主持人，2026-2029。
2. 國家科學及技術委員會，環境友善型生物質衍生加值碳材應用於光熱轉換活化過硫酸鹽整治1,2-二氯乙烷污染地下水之機制與成效研究，主持人，2026-2029。
3. 國家科學及技術委員會，科普活動：點燃山中科普火苗：AI與科普的攜手，共同主持人，2026。
4. 國家科學及技術委員會，科普活動：科普宅急便2.0—送入南投偏鄉吧，共同主持人，2024。
5. 科技部，以碳奈米材料結合近紅外光熱活化過硫酸鹽處理水中1,4-二氧陸圜之研究(延攬博士後研究人才)，主持人，2022。
6. 科技部，以碳奈米材料結合近紅外光熱活化過硫酸鹽處理水中1,4-二氧陸圜之研究，2020-2023。
7. 科技部，科普活動：在非山非市中尋找科學、科技與環境的種苗(主題三) 共同主持人，2022。
8. 科技部，以碳奈米材料結合近紅外光熱活化過硫酸鹽處理水中1,4-二氧陸圜之研究(延攬博士後研究人才)，主持人，2021。
9. 科技部，地方創生、社群協力與大學社會責任：暨大營造「水沙連大學城」續階計畫(3/3)，共同主持人，2021。
10. 科技部，應用智慧監控與資源循環技術優化筊白筍生產環境--應用智慧監控與資源循環技術優化筊白筍生產環境(3/3)，共同主持人，2020。
11. 科技部，以碳奈米材料結合近紅外光熱活化過硫酸鹽處理水中1,4-二氧陸圜之研究(延攬博士後研究人才)，主持人，2020。
12. 科技部，地方創生、社群協力與大學社會責任：暨大營造「水沙連大學城」續階計畫(2/3)，共同主持人，2020。
13. 科技部，應用智慧監控與資源循環技術優化茭白筍生產環境--應用智慧監控與資源循環技術優化筊白筍生產環境(2/3)，共同主持人，2019。
14. 科技部，應用智慧監控與資源循環技術優化筊白筍生產環境--應用智慧監控與資源循環技術優化筊白筍生產環境(1/3)，主持人，2018。
15. 科技部，電化學過硫酸鹽氧化法去除廢水中1,4-二氧陸圜機制之研究，主持人，2017-2020。
16. 科技部，營造水沙連大學城：多層次公共性的跨域創新與實踐(3/3)，2018。
17. 科技部，電化學過硫酸鹽氧化法去除廢水中1,4-二氧陸圜機制之研究(延攬博士後研究人才)，主持人，2018。
18. 科技部，營造綠色水沙連：智能 × 減污 × 循環，協同主持人，2017。
19. 科技部，營造水沙連大學城：多層次公共性的跨域創新與實踐(2/3)，共同主持人，2017。
20. 科技部，以綠色過硫酸鹽整治藥錠處理受三氯乙烯污染之地下水：現地先導試驗，主持人，2016。
21. 科技部，鹼活化過硫酸鹽氧化法自由基生成物種及其對不同有機污染物去除機制之探討，主持人，2014-2017。
22. 科技部，營造水沙連大學城：多層次公共性的跨域創新與實踐(1/3)，共同主持人，2017。
23. 科技部，鹼活化過硫酸鹽氧化法自由基生成物種及其對不同有機污染物去除機制之探討(延攬博士後研究人才)，主持人，2016。
24. 科技部，以光電化學程序去除水中當代有機污染物之研究(補助科學與技術人員國外短期研究)，主持人，2015。
25. 行政院國家科學委員會，不同過硫酸鹽活化系統對土壤微生物族群及石油碳氫化合物自然生物降解之影響：與過氧化氫及過錳酸鹽之比較，主持人，2013。
26. 行政院國家科學委員會，地工織物與織布袋過濾污泥行為之研究(1/3-3/3)，共同主持人，2013-2016。
27. 行政院國家科學委員會，預約水沙連的春天：宜居城鎮的轉型與治理(2/3)，共同主持人，2013。
28. 行政院國家科學委員會，以新穎釋氧化劑整治牆處理受汽油污染之地下水，主持人，2009。

(二)國家科學及技術委員會計畫(產學型)

1. 國家科學及技術委員會，以Geobacillus結合堆肥法高溫生物降解總石油碳氫化合物之研究，主持人，2024。
2. 科技部，以不同電極活化過硫酸鹽藥錠處理受三氯乙烯污染地下水之技術開發，主持人，2020。
3. 科技部，以生物碳/過硫酸鹽整治藥錠加強含氯有機物污染地下水整治成效，主持人，2018。
4. 科技部，新穎友善生物可分解塑膠產製技術之研發，共同主持人，2017-2020。
5. 科技部，以工業廢棄物鹼活化過硫酸鹽整治受含氯有機物污染之地下水，主持人，2015。
6. 科技部，不同過硫酸鹽氧化法應用程序現地處理受三氯乙烯污染地下水之成效及影響評估，主持人，2014。
7. 行政院國家科學委員會，地下水中長效型過硫酸鹽整治藥錠之研發及應用可行性評估，主持人，2013。
8. 行政院國家科學委員會，發展以生物碳及過硫酸鹽為基礎之現地反應牆整治受石油碳氫化合物污染之地下水，主持人，2012。
9. 行政院國家科學委員會，皮革廠污泥同時回收鉻金屬與PHAs技術之研發，共同主持人，2011。
10. 行政院國家科學委員會，以低價吸附劑結合過硫酸鹽氧化法處理受汽油污染之地下水：可行性及再利用之研究，主持人，2010。
11. 行政院國家科學委員會，皮革廢水處理廠廢棄污泥回收再製成生物可分解塑料技術之研發，共同主持人，2010。
12. 行政院國家科學委員會，由實廠廢棄污泥萃取PHA製成生物可分解塑料最佳技術之研發，共同主持人，2009。
13. 行政院國家科學委員會，過硫酸鹽氧化法結合生物復育法整治受油品污染之土壤，主持人，2009。

(三)產官學計畫

1. 環境部，以嗜熱菌現場整治受高碳數石油碳氫化合物污染土壤之技術開發與驗證，主持人，2025。
2. 教育部，綠色水沙連永續環境與人才培育深拓計畫：科技農業×循環經濟×淨零排放，共同主持人，2025。
3. 國家科學及技術委員會，以改質光熱/光敏材料結合近紅外光熱活化過硫酸鹽降解地下水中1,2-二氯乙烷：光熱與光動效應機制探討及生物毒性評估，主持人，2023-2026。
4. 教育部，綠色水沙連永續價值與人才培育升級計畫：科技×循環×淨零，共同主持人，2023-2024。
5. 台灣塑膠工業股份有限公司，麥寮廠區VCM廠地下水化學氧化(過硫酸鹽)模場試驗，主持人，2021。
6. 行政院環境保護署，以新穎循環再生型吸附劑處理砷污染地下水，主持人，2021。
7. 中聯資源股份有限公司，轉爐石瀝青混凝土刨除料工程填方(基地、路堤填築)試辦計畫，主持人，2019-2021。
8. 臺中市政府經濟發展局，臺中市未登記工廠輔導委託專業服務案，共同主持人，2020。
9. 教育部，永續環境推動與人才培育計畫：深耕水沙連×開拓東南亞×邁向SDGs，共同主持人，2020。
10. 行政院環境保護署，綠色洗劑對不同重金屬污染土壤之清洗成效評估：以聚麩胺酸為例，主持人，2019。
11. 教育部，營造綠色水沙連：智能 × 減污 × 循環，協同主持人，2018-2019。
12. 南投縣政府環境保護局，南投縣因應氣候變遷探討(PM2.5事件日)環保業務因應策略之研究計畫，共同主持人，2017。
13. 行政院環境保護署，環境友善型具麩胺酸清洗受重金屬污染土壤之模場試驗，主持人，2017。
14. 南投縣政府環境保護局，103年度因應氣候變遷探討環保業務調適計畫，共同主持人，2014。
15. 行政院環境保護署，以長效型氧化劑結合厭氧生物復育試劑整治受三氯乙烯污染之地下水：整治列車成效及對場址影響綜合評估，主持人，2014。
16. 行政院環境保護署，噪音感受度調查及對健康影響之評估，主持人，2014。
17. 教育部，102學年度第2學期現代公民核心能力課程計畫—單一通識課程發展計畫(B類) ，主持人，2014。
18. 行政院環境保護署，噪音感受度調查及對健康影響之評估，主持人，2013。
19. 行政院環境保護署，陸上運輸系統(高架道路橋面下聲音)噪音管制方式及改善措施之研究，主持人，2012。
20. 教育部，教育部顧問室101學年度第1學期現代公民核心能力課程計畫，主持人，2012。
21. 教育部，100-101年度中區區域教學資源計畫(公民素養融入專業課程)-環境工程(下)，授課教師，2012。
22. 教育部，公民素養陶塑計畫(公民素養融入通識課程)-環境保護導論，授課教師，2011。
23. 行政院環境保護署，陸上運輸系統(高架段伸縮縫)低頻噪音管制方式及改善措施之研究，主持人，2011。
24. 南投縣政府環境保護局，99年度國道噪音及交通環境噪音監測暨易發生噪音設施許可審查計畫，主持人，2010。
25. 行政院環境保護署，新穎釋氧物質於受油品污染之地下水整治與Microtox生物毒性評估技術研發–批次與管柱試驗，協同主持人，2010。
26. 教育部，99學年度第1學期通識教育課程計畫(A類)-全球環境變遷與永續發展，主持人，2010。
27. 南投縣政府環境保護局，99年度河川水質監測研究工作計畫，共同主持人，2010。
28. 工業技術研究院，生物旋轉盤系統處理廢污水之水質分析，主持人，2010。
29. 行政院環境保護署，高速鐵路隧道出口低頻噪音分析與影響之研究，主持人，2010。
30. 南投縣政府環境保護局，98年度河川水質監測研究工作計畫，共同主持人，2009。
31. 南投縣政府環境保護局，98年度國道噪音及交通環境噪音監測暨易發生噪音設施許可審查計畫，主持人，2009。
32. 行政院環境保護署，八八水災災區重建環境輔導與建言團隊 A區(雲、嘉、投)，南投區組長，2009。
33. 南投縣政府環境保護局，97年度國道三號、國道六號及其他道路等交通噪音及環境音量監測評析計畫，主持人，2008。

(四)其他計畫

1. 臺灣國立大學系統，以植物萃取液綠色合成奈米金屬材料：污染整治、抗菌及生物相容性應用評估，主持人，2023。
2. 臺灣國立大學系統，以區域特色農業剩餘資材發展生物炭之永續型環境整治及資源生產應用與生物風險估，主持人，2022。